La loi sur l‘eau et les milieux aquatiques investit la Fédération Nationale de Pêche de missions de service public en matière de protection et gestion durable du milieu aquatique. Elle rend obligatoire l’adhésion des fédérations départementales des associations de pêche et de protection des milieux aquatiques à cet établissement d’utilité publique. Réunissant dans chaque département les associations agréées de pêche et de pisciculture, leur rôle est d'assurer, outre la répression du braconnage, la protection et la reproduction du poisson d'eau douce, et, d'une manière générale, la mise en valeur des eaux douces. Le Conseil d'administration des fédérations départementales est élu par l'assemblée générale du département qui comprend des délégués de chaque association de pêcheurs. Cette élection doit recevoir l'agrément du Ministre chargé de l'Environnement et du Préfet.